MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 106790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011071	GATG	2	8	214	221	25 %	25 %	50 %	0 %	194363779
2	NC_011071	CCG	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363779
3	NC_011071	TCG	2	6	348	353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
4	NC_011071	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
5	NC_011071	TCG	2	6	561	566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
6	NC_011071	GCA	2	6	573	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363779
7	NC_011071	GGC	2	6	607	612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363779
8	NC_011071	GCT	3	9	643	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
9	NC_011071	CGC	2	6	691	696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363779
10	NC_011071	TTC	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363779
11	NC_011071	GAT	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363779
12	NC_011071	CAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363779
13	NC_011071	GCT	2	6	835	840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
14	NC_011071	TTC	2	6	857	862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363779
15	NC_011071	TTC	2	6	890	895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363779
16	NC_011071	GTT	2	6	910	915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194363779
17	NC_011071	AGC	2	6	924	929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363779
18	NC_011071	ATC	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363779
19	NC_011071	CG	3	6	957	962	0 %	0 %	50 %	50 %	194363779
20	NC_011071	GC	3	6	980	985	0 %	0 %	50 %	50 %	194363779
21	NC_011071	GTCG	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	194363779
22	NC_011071	CCG	2	6	1028	1033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363779
23	NC_011071	CG	3	6	1046	1051	0 %	0 %	50 %	50 %	194363779
24	NC_011071	GAT	2	6	1097	1102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363779
25	NC_011071	AAG	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363779
26	NC_011071	GC	3	6	1155	1160	0 %	0 %	50 %	50 %	194363779
27	NC_011071	CAC	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363779
28	NC_011071	CTG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
29	NC_011071	CAG	3	9	1250	1258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363779
30	NC_011071	ACT	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363779
31	NC_011071	CTG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
32	NC_011071	GCCT	2	8	1404	1411	0 %	25 %	25 %	50 %	194363779
33	NC_011071	ACCAC	2	10	1440	1449	40 %	0 %	0 %	60 %	194363779
34	NC_011071	TGC	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363779
35	NC_011071	TGCC	2	8	1459	1466	0 %	25 %	25 %	50 %	194363779
36	NC_011071	ATG	2	6	1543	1548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363779
37	NC_011071	GTC	2	6	1871	1876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363780
38	NC_011071	CGC	2	6	1889	1894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363780
39	NC_011071	CCCG	2	8	2030	2037	0 %	0 %	25 %	75 %	194363780
40	NC_011071	ATC	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363780
41	NC_011071	GCAG	2	8	2116	2123	25 %	0 %	50 %	25 %	194363780
42	NC_011071	CAG	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363780
43	NC_011071	CTA	2	6	2275	2280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363780
44	NC_011071	CTG	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363780
45	NC_011071	GTG	2	6	2307	2312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363780
46	NC_011071	ATC	2	6	2399	2404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363780
47	NC_011071	GCG	2	6	2448	2453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363780
48	NC_011071	CGA	2	6	2503	2508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363780
49	NC_011071	TCACCT	2	12	2511	2522	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	194363780
50	NC_011071	TGCG	2	8	2610	2617	0 %	25 %	50 %	25 %	194363780
51	NC_011071	GCG	2	6	2630	2635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363780
52	NC_011071	ACC	2	6	2750	2755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363780
53	NC_011071	CTG	2	6	2792	2797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363780
54	NC_011071	CGA	2	6	2818	2823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363780
55	NC_011071	TCA	2	6	2829	2834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363780
56	NC_011071	CTC	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194363780
57	NC_011071	CAG	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363780
58	NC_011071	GTG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363780
59	NC_011071	CCG	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363781
60	NC_011071	CCTTG	2	10	3935	3944	0 %	40 %	20 %	40 %	194363781
61	NC_011071	CT	3	6	3975	3980	0 %	50 %	0 %	50 %	194363781
62	NC_011071	CTG	2	6	3999	4004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363781
63	NC_011071	TGGTC	2	10	4094	4103	0 %	40 %	40 %	20 %	194363781
64	NC_011071	GC	3	6	4151	4156	0 %	0 %	50 %	50 %	194363781
65	NC_011071	CTC	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194363781
66	NC_011071	TGC	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363781
67	NC_011071	GGT	2	6	4271	4276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363781
68	NC_011071	GCG	2	6	4315	4320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363781
69	NC_011071	CGC	2	6	4326	4331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363781
70	NC_011071	GGGC	2	8	4433	4440	0 %	0 %	75 %	25 %	194363781
71	NC_011071	AGGC	2	8	4480	4487	25 %	0 %	50 %	25 %	194363781
72	NC_011071	GCC	3	9	4501	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363781
73	NC_011071	GCA	2	6	4529	4534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363781
74	NC_011071	GCG	2	6	4551	4556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363781
75	NC_011071	GCT	3	9	4637	4645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363781
76	NC_011071	GGCCA	2	10	4752	4761	20 %	0 %	40 %	40 %	194363781
77	NC_011071	GCCT	2	8	4776	4783	0 %	25 %	25 %	50 %	194363781
78	NC_011071	CCA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363781
79	NC_011071	CGG	2	6	4901	4906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363781
80	NC_011071	CGG	2	6	4942	4947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363781
81	NC_011071	CGA	2	6	5133	5138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
82	NC_011071	AAC	2	6	5155	5160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363782
83	NC_011071	ACG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
84	NC_011071	CAC	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363782
85	NC_011071	GGT	2	6	5280	5285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363782
86	NC_011071	CGA	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
87	NC_011071	GTG	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363782
88	NC_011071	GGC	2	6	5473	5478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363782
89	NC_011071	CGA	2	6	5484	5489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
90	NC_011071	GGCGTC	2	12	5521	5532	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194363782
91	NC_011071	GCT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
92	NC_011071	CAG	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
93	NC_011071	CAC	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363782
94	NC_011071	CGA	2	6	5790	5795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
95	NC_011071	GTG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363782
96	NC_011071	GCC	2	6	5807	5812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
97	NC_011071	TCG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
98	NC_011071	CAA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363782
99	NC_011071	GTG	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363782
100	NC_011071	CAA	2	6	5985	5990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363782
101	NC_011071	GGT	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363782
102	NC_011071	GC	3	6	6035	6040	0 %	0 %	50 %	50 %	194363782
103	NC_011071	CAA	2	6	6054	6059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363782
104	NC_011071	CGA	2	6	6111	6116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
105	NC_011071	CCAG	2	8	6173	6180	25 %	0 %	25 %	50 %	194363782
106	NC_011071	CCG	2	6	6215	6220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
107	NC_011071	CGAA	2	8	6269	6276	50 %	0 %	25 %	25 %	194363782
108	NC_011071	TCG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
109	NC_011071	CGC	2	6	6306	6311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
110	NC_011071	CG	3	6	6327	6332	0 %	0 %	50 %	50 %	194363782
111	NC_011071	CGC	2	6	6352	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
112	NC_011071	TCG	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
113	NC_011071	CCGCAA	2	12	6480	6491	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	194363782
114	NC_011071	TGC	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
115	NC_011071	CG	4	8	6538	6545	0 %	0 %	50 %	50 %	194363782
116	NC_011071	CGA	2	6	6615	6620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
117	NC_011071	ATC	3	9	6652	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363782
118	NC_011071	CCGACG	2	12	6665	6676	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	194363782
119	NC_011071	GCT	3	9	6699	6707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
120	NC_011071	TTC	2	6	6712	6717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363782
121	NC_011071	GCC	2	6	6768	6773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
122	NC_011071	GAC	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
123	NC_011071	CAG	2	6	6846	6851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
124	NC_011071	CGCTG	2	10	6864	6873	0 %	20 %	40 %	40 %	194363782
125	NC_011071	GCT	3	9	6921	6929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
126	NC_011071	CGC	3	9	6936	6944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
127	NC_011071	TCGA	2	8	6952	6959	25 %	25 %	25 %	25 %	194363782
128	NC_011071	ATGGAC	2	12	7018	7029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	194363782
129	NC_011071	GGCGAA	2	12	7045	7056	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	194363782
130	NC_011071	AGC	2	6	7139	7144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363782
131	NC_011071	CGC	2	6	7168	7173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363782
132	NC_011071	TGC	2	6	7199	7204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
133	NC_011071	TGCG	2	8	7232	7239	0 %	25 %	50 %	25 %	194363782
134	NC_011071	CCA	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363782
135	NC_011071	GCT	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
136	NC_011071	TCGA	2	8	7309	7316	25 %	25 %	25 %	25 %	194363782
137	NC_011071	GCT	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
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140	NC_011071	CTG	2	6	7456	7461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363782
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150	NC_011071	CTG	3	9	7955	7963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363783
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250	NC_011071	GGC	2	6	11966	11971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363787
251	NC_011071	TCG	2	6	12012	12017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363787
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255	NC_011071	CTG	2	6	12116	12121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363787
256	NC_011071	GC	3	6	12144	12149	0 %	0 %	50 %	50 %	194363787
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489	NC_011071	ATGAA	2	10	22986	22995	60 %	20 %	20 %	0 %	194363796
490	NC_011071	CGGC	2	8	23058	23065	0 %	0 %	50 %	50 %	194363796
491	NC_011071	GAA	2	6	23093	23098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363796
492	NC_011071	GCG	2	6	23135	23140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363796
493	NC_011071	C	6	6	23237	23242	0 %	0 %	0 %	100 %	194363797
494	NC_011071	AAC	2	6	23244	23249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363797
495	NC_011071	TGGGTG	2	12	23322	23333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363797
496	NC_011071	GTC	2	6	23420	23425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363797
497	NC_011071	GCC	2	6	23513	23518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363797
498	NC_011071	CGCC	2	8	23521	23528	0 %	0 %	25 %	75 %	194363797
499	NC_011071	GCAG	2	8	23560	23567	25 %	0 %	50 %	25 %	194363797
500	NC_011071	GCT	3	9	23587	23595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363797

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